Lehden mukaan eduskunnan kansliatoimikunta joutui viime syksynä myöntämään Upille poikkeuksellisen 200 000 lisämäärärahan määräaikaisten tutkijoiden palkkojen kattamiseksi. Rahapulan taustalla kerrotaan olevan monia syitä, kuten Upin ennätyksellisen laaja toiminta vuonna 2023 ja aiempaa heikommat talousnäkymät.

Instituutin taloustilanteen kerrotaan olevan edelleen vaikea. Tammikuun lopulla instituutin julkaisemassa Ulkopoliitikka-lehdessä alkoivat muutosneuvottelut, jotka voivat johtaa enimmillään kahden ihmisen irtisanomiseen. HS:n mukaan instituutissa pelätään koko lehden lakkauttamista.

Aaltola valittiin Upin johtajaksi vuonna 2019. Hän siirtyi pois johtotehtävistä elokuun 2023 alussa. HS:n mukaan Aaltolan aikana instituutin henkilöstöä kasvatettiin, perustettiin tutkimuskeskuksia ja lanseerattiin turvallisuuspoliittinen konferenssi Helsinki Security Forum. Myös ulkopuolista rahoitusta Aaltolan aikana saatiin aiempaa enemmän.